Медленнее ли работает жёсткий диск, если на нём много информации?

Давайте разбираться. Скорость работы жесткого диска это: время позиционирования головки, скорость чтения, скорость записи, время поиска в таблицах файловой системы информации о местонахождении файлов и их частей.

Время позиционирования на чистом (почти чистом) не фрагментированном диске, разумеется, ниже, но несущественно - и головка движется быстро, да и не одна она на нынешних хардах. Тем не менее, скажем, последовательное чтение на фрагментированном заполненном харде будет выше.

Скорости чтения и записи никак не зависят от заполненности диска. Разве что через поиск информации в таблицах файловой системы - о свободных блоках, скажем - для записи. Но, опять-таки это все крайне малые величины. Скорость работы гораздо сильнее зависит от размера кластера, размера файлов, с которыми осуществляется работа и т. п.

То есть, технически - да, зависимость должна быть, но она весьма мала. Есть факторы, куда более влияющие на скорость работы харда.