Какие минусы обучение в негосударственном ВУЗе?

Да вроде никаких. Выпускники негосударственных вузов также получают дипломы государственного образца. Преподавательский состав там такой же, как и в государственных, по той простой причине, что профессора и доценты работают по совместительству в нескольких учебных заведениях. Стоимость платного обучения в частных вузах сопоставима, а иногда даже и ниже, чем в государственных. Сейчас даже некоторые негосударственные вузы могут обучать студентов за счет бюджетных средств (правда, только по востребованным специальностям).

А от рисков лишения лицензии, к сожалению, не застрахованы ни те, ни другие. Так что особой разницы нет, где обучаться.