Как проверить слово вагон (букву а)?

Да, слово вагон можно проверить, но под ударением стоит второй слог. А написание а после в надо запомнить или подобрать для памяти ряд слов иностранного происхождения, которые пишутся на -ва-: ватт, ваттерпас, вагон, вагина. Или затвердить предложение: Вагина в вагоне. Тогда легко запомнить и детям, и весьма взрослым представителям людского рода.

Ва-гон, в этом слове два слога, ударный слог ГОН.

Следовательно в перовом слоге есть гласная в безударном положении, но ее, увы, проверить невозможно, поэтому-то слово запоминаем, чтобы не написать вместо ВАгон слово ВОгон.

Вагон - словарное слово.