Чьи фамилии заканчиваются на «ус»? Всегда ли это литовские корни?

У фамилий нет чёткой привязанности "концовки" к происхождению. Хотя у большинства русских они заканчиваются на -ов, а у грузин на -дзе, из этого статистического явления нельзя выводить глобальное правило.

Маргулис - это еврейская фамилия, причём бывает в вариантах Марголис, Маргулин и даже Марголян.

Белоус - славянская, наибольший шанс её встретить - у украинцев. У кого-то из предков человека были белые усы - оттуда и взялся "ус".

Что до фамилии Маркус, то предку её современного носителя достаточно было жить где-нибудь подле католического собора, монастыря или лазарета Св. Марка, чтобы у него появилось прозвище "Маркус" независимо от его этнического происхождения и вероисповедания.

Фамилии появились из прозвищ, а прозвища давали с целью различать людей с одинаковыми именами. Так и получалось, что один Иван был Петровым, а другой - Кривоножкой, в ход для маркировки шло всё, особенно когда о человеке нечего сказать.

Вопрос был задан из-за того, что разгорелся спор чье происхождение имеет фамилия Маркус. Часть придерживалась озвученной в вопросе версии, а часть склонялась к происхождению от древнеримского Gaius Marcius Coriolanus, жившего в 470-e гг. до н. э. — ?) от патриц. преномена Mar(п)ius, происх. от лат. mare - "утро"(сравним заодно "марево":)Publius, Lucius, Marcus, больше известного как Марций Кориолан.

Иная версия от имени Марка, мне кажется ненадежной, так как фамилия изначально отвечала на вопрос: "Ты чей?" если от Марка - то Маркин, но не Маркус.

У меня есть знакомая по фамилии Маркус, она немка.

Фамилии на -ус могут носить также шведы, например, у второй жены Достоевского Анны Сниткиной, мать была урождённая Мильтопеус, шведка. Можно вспомнить ещё солиста группы АББА Бьорна Ульвеуса, у которого тоже фамилия на -ус.

Есть русские фамилии, оканчивающиеся на -ус: Белоус, Черноус и т.п.

Для литовских фамилий более характерны -ас, -ис и -юс на конце.

Ну, почему же... Неоднократно в литературе и истории встречались фамилии типа Преториус, Сорториус или Понтус у немцев, голландцев, шведов и датчан... А фамилии, заканчивающиеся на -ис носит большинство греков - Теодоракис, Костакис и т.д.