Почему церковь так жестоко расправлялась с еретиками?

Просто устраняла конкурентов, т. к. вся ложная религия это большой бизнес основанный на религиозных чувствах людей.

Потому что еретики порождают в пастве сомнения. Сомнения, в свою очередь, порождают мысли. А думающая паства не нужна ни одной церкви. Борьба с еретичеством - это разновидность цензуры. В разное время еретиками объявлялись даже ученые, открытия которых не стыковались со священным писаниям.