Можно ли в яндекс браузере запомненые закладки группировать?

Думаю, группировать закладки можно в любом браузере. В этом смысле мне в свое время нравилась Опера, она их сохраняла не в баре для закладок, а в папках. По-моему, хуже всего сохранение закладок реализовано в Хроме, хотя и и пользуюсь им постоянно) Что вам мешает навести порядок с закладками собственноручно: откройте в браузере диспетчер закладок, создайте новые папки, присвойте им имена, распихайте сохраненные закладки по папкам и в будущем сохраняйте закладки сразу в нужной папке. А что бы их не потерять при переустановке системы сохраните их в облаке или экспортируйте в html-файл.