Какой залог брать за инструмент?

Паспорт оставлять в залог нельзя, законадательно запрещено. Да и смысла лично вам, как арендодателю, нет.

За полную стоимость инструмента- навряд ли кто будет брать его в аренду.

Смотря какой инструмент. Обычно, фиксированная сумма залога (500, 1000, 2000 в зависимости от цены инструмета), но не более 50% получается. + стоимость аренды (часовая или дневная). Суммарно получается почти полная стоимость инструмента. Если аренда длительная, то залог никак не будет больше стоимости инструмента.

Частенько пользуюсь услугами аренды, бывает что и ломается. Везде условия аренды и цена примерно одинаковые.