Являются ли однокоренными слова дактиль и птеродактиль?

Да, эти слова однокоренные. "Дактилос" - по латыни "палец".

Дактиль - трёхстопный стихотворный размер: первый слог ударный (из-за этого он чуть длиннее получается), второй и третий безударные, они короче. Получается что-то типа "тААА-та-та". Поэтому он и получил такое название: у пальца тоже первая фаланга длинная, а вторая и третья короткие. Вот пример стихотворения, написанного дактилем:

Теперь про птеродактиля. "Птерос" - по латыни "крылатый". То есть "птеродактиль" - это существо с крыльями и пальцами, точнее, с "крылатыми пальцами". Именно этой чертой он и удивителен, этим и отличается от остальных ящеров.