Что будет, если мой диплом не пройдет антиплагиат?

Это уже будет решать экзаменационная комиссия. Максимум, что они могут сделать, это заставить вас переделать дипломную работу. Ну, это уже надо просто "тупо" перепечатать другой диплом. А так, за схожесть могут снять бал или два, это зависит от степени схожести и на какую оценку вы защитили диплом.

У вас будет еще время для того, чтобы сделать исправления в дипломной работе, потому что работы на плагиат сдаются заранее. Не так уж страшно все это, какие то главы немного переделать, что-то добавить, местами поменять.