Были, были — и бояре волком выли. В чем смысл?

Смысл в том, что тут нет запятой. "Были были - и бояре волком выли". Первое "были" - это глагол "быть" в прошедшем времени, второе - существительное "быль" во множественном числе.

Не то чтоб это делало присказку понятнее, но так вырисовывается хоть чего-то. Примерно того же типа, что "мели Емеля, твоя неделя...", "если бы да кабы да во рту бы росли бы грибы...", "ага, щаззз...". То есть тут выражается явный скепсис в том, что говорит чувак, кому адресована эта фраза.