Всегда ли честен Мегафон при подсчете трафика с мобильного gps-модема?

Особо Мегафону, да и любому другому оператору "обманывать" смысла нет. Во первых, программы биллинга практически всегда сертифицированы, а значит проверены на правильность подсчёта трафика. Во вторых, не забывайте, что всегда есть служебный трафик. Это как примерно конфетка в нескольких обёртках.

К примеру получаете Вы электронное пиьсмо с влолжением почтовой программой. К примеру размер вложения 1 Мбайт, но на самом деле принимается информация размером 1,33 МБайт, т.к. все вложения кодируюся обычно кодировкой BASE64 и их размер становится на треть больше. И это еще не считая информации служебного заголовка письма. А Вы видите письмо, к которому прикреплён файл размером 1 МБайт. И таких примеров можно привести много.

Так что скорее всего с подсчётом трафика у Мегафона всё нормально.