В чем разница между микроволновым и терагерцовым излучением?

В диапазоне.

Микроволновое - это, если верить Википедии, излучение в диапазоне от 1 до 40 ГГц (40 ГГЦ - это длина волны 7,5 мм). Терагерцовое - это, как следует из названия, излучение с частотами в 1 ТГц и выше. То есть примерно на полтора-два порядка выше частота (и, соответственно, короче длина волны: 1 ТГц соответствует длине волны в 0,3 мм, это уже близко к дальнему ИК...).