В аквариуме появились полупрозрачные червячки, как ниточки, почему?

Если ваши червячки прозрачные-белые и длинные, как ниточки, то это больше всего похоже на Нематоды. Вы могли их занести в аквариум с новыми растениями, и считаются они безобидными, ими кормят рыб, специально разводят.

Хотя это может быть и Планарии.

Если очень мешают одно из средств Фебендазол, применять по инструкции.