У меня есть высокая подруга, но её родственники маленького роста. Как так?

Достаточно одного высокого какого-нибудь пра-пра-прадеда, чтобы Вашей подруге передался его ген. Вот и всё.

А если ну вообще никого не было высокого в роду (что сомнительно), то у Вашей подруги может быть гормональный фон таков. Гормоны роста у неё в избытке.