С помощью чего тормозит самолёт?

Самолёт тормозит двигателями. Пилоты убавляют режим - тяга уменьшается, вместе с нею уменьшается скорость и, следовательно, высота. Ещё есть такие штуки, как воздушные тормоза. Интерцепторы, спойлер-интерцепторы. То есть пластины, в обычном режиме прижатые к фюзеляжу или крылу, которые могут отклоняться в воздушный поток и увеличивать площадь фронтальной проекции самолёта, создавая дополнительное лобовое сопротивление. Эти штуки могут действовать как в воздухе, так и на земле. На схеме механизации интерцепторы можно увидеть здесь.

Также на земле используется реверс двигателей. Подробности см. в этом ответе.

У военных самолётов бывают и дополнительные приспособления: тормозные парашюты. А на палубных самолётах - тормозной гак (крюк, цепляющийся за аэрофинишёры - тросы, натянутые поперёк палубы авианосца).