Почему жена постоянно командует?

Потому что вы ей разрешаете.

А вообще нужно разбираться, что и какие устои были в ее семье.

Если она была один ребенок, а мама в доме главная, то и пример будет браться с мамы.

Возможно, у нее есть младшие братья и сестры с большой разницей в возрасте. Тогда командование произрастает отсюда.

Если вас это устраивало всегда, а теперь не устраивает, то лучше принять и простить.