Почему в первых 12 главах романа ни разу не упомянут Мастер?

Он и в остальных главах не сильно упомянут. Вспомните, что конкретно он делает? Мы даже имени его не знаем. Мастер написал рукопись, он весь - в произведении. Булгаков словно намекает любителям покопаться в биографиях литераторов, желающим узнать там великую сермяжную правду, без которой их сочинений якобы не понять. Книга - это и есть автор изнутри. Не ищите ответы на вопросы о личности в бытовых подробностях. Поэтому подлинный Мастер, его внутреннее содержание, появляется уже во второй главе - "Понтий Пилат". Мы смотрим на мир его глазами, читая роман в романе.

Читатель принимает установку "написанное Мастером - подлинная история Иешуа Га-Ноцри". Таков авторский замысел Булгакова. Не то, что в Библии написано, и не то, что твердит советская атеистическая пропаганда, но некая "третья версия", увидеть её неким внутренним зрением и изложить на бумаге удалось лишь безымянному герою. Судя по тому, что Воланд так заинтересован в овладении его душой, перед нами версия от дьявола, которого атеизм не устраивает тем, что отрицает существование не только Бога и Христа, но и сатаны.

Ради души и порождённого ею текста дьявол появляется в Москве. Повод - ежегодный бал, который должна провести очередная Маргарита. Каждый год века подряд враг человеческий находил нужную хозяйку торжества без проблем, в этот раз добрался до московской психушки. Почему? Воланду нужна была женщина, любившая мужчину больше Бога, но не жаждавшая материальных благ. Первое - глубоко греховно, второе - мелко и обыденно. Воланду понадобился грех с размахом, посягающий на Творца, - его предъявляет и душа Мастера, воплотившая кощунственное видение библейских событий, и не ужаснувшаяся этому женщина.

Формально появившийся лишь к 13 ("несчастливой") Мастер является фактически постоянно присутствующим в книге.

Потому, что Мастер не главный герой произведения, а героически пошедший против течения человек. Его поступок героический. Потому он и герой.