Почему считается, что если заяц перебежал дорогу, это плохая примета?

Это давняя примета времен Пушкина. Потом ее вытеснил западный вариант - с кошкой.

Рациональное объяснение у нее очевидно: заяц от людей обычно убегает. И если заяц бежит вам наперерез - видимо, он убегает от такой опасности, когда человека можно и проигнорировать. Стало быть, эта опасность грозит и человеку, чей путь заяц пересек.