Почему с родовым сертификатом платят за роды?

Ну платные роды к сертификату не имеют никакого отношения.

Сертификат - это больше документ для мед учреждений: для женской консультации, где беременная стоит на учете; для роддома, где женщина будет рожать; а также детской поликлиники, в которой ребенок будет под наблюдением до исполнения года. Оплачивает все это федеральный бюджет.

А вот платные роды - платная услуга по желанию женщины, чтобы процесс родов прошел максимально удачно и выбранным роженицей врачом.