Почему летающих ящеров сменили птицы, это ведь даже не эволюция?

Рептилии (то, что в вопросе названо ящерами, это рептилии) дали начало бифуркирующей эволюции - появлению птиц и млекопитающих, которые приобрели теплокровность, что и позволило им захватить экологические ниши, которые раньше принадлежали рептилиям ил распространиться в более эктремальных условиях. Что касается отсутствия промежуточных стадий, то это неверно. Информация об археоптериксе содержится даже в школьных учебниках, а у него уже были перья. На Дальнем Востоке целиком откопан динозавр, имеющий сходство с уткой, правда очень большей. Примеров можно приводить много. Доказательством происхождения птиц от рептилий является филогенез в онтогенезе, то есть краткое прохождение эволюционного пути вида во внутриутробном развитии. Стадию рептилии проходят все птицы, как, впрочем, и млекопитающие, включая человека. Ископаемые останки промежуточных стадий можно и не найти, а филогенез в онтогенезе никуда не спрячешь, он есть у каждой особи и у каждого вида. Это самое железобетонное доказательство происхождения.

Климат на планете менялся в сторону похолодания. Холоднокровным ящерам стало тяжелее, ведь они зависимы от температуры окружающей среды. Птицы имели целый ряд преимуществ перед ними:

1. теплокровность - быстрые процессы обмена веществ, скорость реакций, независимость от температуры.
2. Развитый мозг и зрение - быстрая и успешная охота, добыча пищи. и др. качества
3. Больший объём легких и лучшее снабжение тела кислородом - "двойное дыхание" за счёт воздушных мешков
4. Более обтекаемое тело и перьевой покров.
5. Яйца в плотной известковой скорлупе + насиживание

А сходство с ящерами всё же есть:

Чешуя на лапах, некоторые другие особенности строения. Птицы вытеснили ящеров, так как имели более выгодные приспособления к выживанию в сменившемся климате и др. условиях.