Почему бонусы при получении наград не включаются в репутацию?

Вы наверное, что-то путаете. Бонусы к репутации не могут прибавляться. Бонусы - это кредиты и они засчитываются на баланс. Посмотрите в своем профиле: Финансы--> Баланс. Там видно все: когда и за что начислены кредиты, в том числе и бонусы.