Негосударственное учреждение, влияет ли это на будующее человека?

Смотря в какую организацию, ведь согласитесь что и дипломы государственных учебных заведений имеют то же разный рейтинг-диплом заштатного ВУЗа из глубинки и аналогичный, но выданный МГУ или МГИМО, так что на обычном уровне вряд ли это скажется, а вот для устройства на руководящие должности в серьезные компании или госслужбу может сыграть роль, впрочем можно будет получить второе образование в профильном государственном ВУЗе на базе Вашего диплома и решить эту проблему, если это будет необходимо для дальнейшей карьеры.