Можно ли при помощи AMMYY управлять компьютером без ведома пользователя?

Нет конечно же, в данном случае такие действия являются незаконными и влекут за собой уголовную ответственность. Слежка за компьютером либо же удаленное управление компьютером возможно только при разрешении того пользователя, чьим компьютером собираются манипулировать. Ну а если же это делать все в тайне и пользователь даже ничего и не заподозрит, тогда вам повезло. А для проверки на удаленное управление вашим компьютером существуют ряд из нескольких программ, которые показывают статистику управления всеми девайсами на удаленном расстоянии.