Можно ли прекратить уголовное дело по ч.2 ст. 264 УК РФ?

Теоретически никаких препятствий к этому нет, эта статья в отношении применения к ней, рассматриваемой процедуры ничем особым образом не выделена.

Для детального ответа надо понимать какое именно основание для прекращения дела имеется в виду в данном конкретном случае.

Пока только можно сказать, что очевидно не пройдет основание, предусмотренное ст.28 УПК РФ /деятельное раскаяние/ просто в силу тяжести преступления.