Куда деются старые файлы с интернета (читайте далее)?

Ну да, в основном так и происходит. Либо этим занимается администратор сервиса (или контент-менеджер) в ручном режиме. Либо программа, установленная на сервере, в автоматическом режиме при наступлении определённых условий. Этими условиями могут быть: отсутствие запросов к файлу в течение длительного времени; снижение количества свободного места в хранилище сервера; появление более новой версии файла; ну и просто завершение срока хранения файла (вне зависимости от наличия обращений к нему).