Какими войсками командует адмирал?

Военно-морскими. Адмирал - один из высших чинов, которые ввел еще Петр первый. Адмирал соответствует званию "полный" генерал, т. е. контр-адмирал - это как генерал-майор, вице-адмирал - это генерал-лейтенант, адмирал - это полный генерал.

Самым вышим чином в военно-морских силах является адмирал. Такие знаменитые адмиралы нашего флота как, например, Фёдор Фёдорович Ушаков прославили российский флот. Фёдор Ушаков изобрёл манёвренную тактику морского боя, которую теперь изучают в высших военных заведениях, которые готовят морских офицеров.

Вы можете подробно почитать об адмирале Ушакове вот в этой интересной статье:

Ушаков Федор Федорович. История жизни

Адмирал командует флотом. Есть ещё контр-адмирал и вице-адмирал.

Весь смысл в слове адмирал. Конечно же Военно-морскими силами!