Какие недостатки у национальной платежной системы?

Недостатки национальной платёжной системы вполне предсказуемы.

Основной из них - это возможность использования исключительно (или почти исключительно) на территории России и в рублёвых расчётах и платежах.

Ни произвести экспортные или импортные торговые операции, ни купить для себя товар за границей, ни обналичить средства, находясь за рубежом нельзя будет в ней.