Какие группы животных изучаются гидробиологией?

Самые разные. Планктон, бентос, всех пелагических животных (тех, что плавают в толще воды), как позвоночных, так и беспозвоночных. Кроме этого есть несколько групп, обитающих в окрестностях границы воды и атмосферы под ней, непосредственно на ней (насекомые!) и полу погружённые. Последние, правда, не животные (а гидробиология изучает не только животных, но и растения и их симбиозы с животными), а, например, мангровые леса. Кроме этого отдельно изучают организмы, живущие на погружённых в толщу воды объектах или предметах. Перечислять все-всех подробно - долго. Да и не для того задан был вопрос. Если есть задача - нужно рыть в специальной литературе. А коротко - вот так.