Какая частица самая маленькая?

По отношению к элементарным частицам некорректно говорить о том, большие они или маленькие. Например, кварки, предположительно, являются самыми маленькими геометрически, но при этом они намного тяжелее, скажем, нейтрино. К тому же кварки пока в свободном виде не обнаружились.

Фотоны вообще ничего не весят, но их размер вообще не имеет физического смысла.

И да, физика элементарных частиц способна сломать мозг.

Раньше считалось что атом, а теперь говорят, что есть частичка ещё более мелкая и называется она кварк

Меньше атома- это его составляющее: нейтрон, протон, электрон.