Как правильно поставить индексы в MySQL?

Ставить индексы лучше профессионалам, иначе будет ограничение: будут найдены подходящие строки, но потом поиск может прекратиться из-за того, что индекс наткнется на не отвечающую запросу строку. Это создаст большие неудобства в работе. Примеры некоторых индексов можно посмотреть здесь.

Если будете ставить просто так — рискуете снизить производительность MySQL. Самый простой метод — это выбрать один из медленных запросов и поставить индекс на колонку, которая используется в WHERE:? выполнено.