Как наказывали тех, кто был против никоновской реформы?

Ряба,

вкратце познакомиться с означенной вами темой можно, например, здесь.

Объективно как тенденция исторического процесса необходимость реформы, конечно, существовала, но

в замыслах Никона, как выявилось позднее, было подмять царскую власть под себя, что превращало религиозно-культовые игры в средство достижения политических целей.

Этот аспект и подчеркивается страшными расправами с противниками церковных реформ.

Аввакума сожгли заживо, и других тоже жгли и обезглавливали.

Соловецкий монастырь выдержал восьмилетнюю осаду.

Старообрядцы и сами себя сжигали, выражая крайний протест, и только во времена Екатерины Второй эти "гари" закончились.