Если объединить 2 раздела диска в один, данные исчезнут (важно хоть с 1)?

Пропадут с обоих. Система заново разметит диск, а старую разметку сотрет. Новый раздел еще и форматировать придется.

А чем Вы объединяете диски?

Можно. Даже могу дать ссылку на программу Acronis Partition Expert.

Тем не менее, рекомендую подстраховаться и переписать наиболее важную информацию на отдельный диск/флэшку, так, на всякий случай.

У них можно получить пробную версию.

Есть и другие программы, но с этой я работал и потому рекомендую.

Пробовал проводить такие манипуляции с помощью Acronis Disk Director, хотя там и было предупреждение, что можно потерять данные, но у меня всё получилось без резервирования. Так что при желании, выбрав нужный софт, можно это делать.