Чем САПР отличается от ГИС?

Это совершенно разные категории программ. САПР - это система автоматизированного проектирования. Такие программы существуют в различных отраслях. Есть САПР для разработки схем и моделирования их работы, есть САПР для печатных плат, есть САПР для создания самолетов, есть САПР для создания станков, есть САПР для создания аттракционов, есть САПР для создания моделей одежды или раскроя ткани на швейном производстве и т.д. ГИС - это геоинформационная система. По сути это карта, разбитая на множество слоев, содержащих различную информацию.