Чем могут быть опасны Root — права и какую угрозу они несут?

Как минимум - воровство и/или порчу информации, как максимум - физический выход из строя устройства (имеется ввиду root-права для различных мобильных устройств).

Вообще, как правило, под пользователем root производится конфигурирование устройств и системы в целом, также если с системой работают несколько пользователей возможна утечка персональных данных.

Вообще, существует так называемый патч Бармина (не привожу здесь) - команда способная уничтожить данные на всех подмонтированных файловых системах, будучи выполнена с правами суперпользователя (root).

Если нужна частая правка конфигурационных файлов, лучше всего завести отдельного пользователя (например admin) и включить его в группу wheel (системные администраторы), также отредактировать файл sudoers и выполнять конфигурирование по средствам команды sudo.

В современных дистрибъютивах Linux присутствует защита от явно "глупых" действий пользователя с правами root (служба называется SELinux), однако, и она не является панацеей.