Почему бывают темноглазые натуральные блондины и светлоглазые нат. брюнеты?

Да, действительно, карие глаза и тёмные волосы являются доминантными признаками. То есть, соотношение вероятностей тёмные глаза/светлые глаза, так же как и тёмные волосы/светлые волосы в гибридном потомстве составляет 3:1, как гласит закон Менделя, упомянутый в комментарии к вопросу.

Однако эти признаки наследуются отдельно друг от друга, и отвечающие за них гены лежат в разных локусах (участках хромосом). Так в локусе цвета глаз (обозначим его условно буквой А) парных (полученных от отца и от матери) гомологичных (соответствующих друг другу) хромосом лежат два аллельных (отвечающих за один и тот же признак) гена: доминантный ген А и рецессивный ген а - получаем сочетание Аа. Цвет глаз будет тёмным. Таким же он будет в случае сочетания двух доминантных генов - АА. Но в первом случае глаза могут быть более светлыми, даже зелёными в результате неполного доминирования.

А в локусе цвета волос В лежат два рецессивных гена в - получаем вариант сочетания вв, в результате чего цвет волос окажется светлым. Нашего индивидума можно описать формулами: Аавв или ААвв. Тогда светлоглазого брюнета опишем формулами ааВв или ааВВ. Надеюсь, понятно.